Джон Блекторн, англійський корабельний лоцман, чиє судно зазнало аварії на японському узбережжі на початку 16 століття, змушений мати справу з двома наймогутнішими людьми Японії того часу. Він опиняється в епіцентрі війни між Торанаґою та Ішідо, які борються за титул шьоґуна, що дасть безмежну владу тому, хто його здобуде.

Шьоґун тривав 1 сезон. Нових епізодів не заплановано.