Події відбуваються в 1943 році під час роботи над «Мангеттенським проектом» в одному з міст штату Нью-Мексико, про який зовнішній світ не підозрює. Федеральний уряд каже вченим тільки те, що вони повинні знати, поки ті в свою чергу зберігають таємниці від своїх сімей.

Мангеттен тривав 2 сезони. Нових епізодів не заплановано.