Попри те, що головна героїня Харухі, оповідь йде від імені Кьона — її однокласника. Кьон тільки перейшов у старшу школу і під час першого уроку в новому класі помітив ексцентричну дівчину, яка сиділа за сусідньою партою. Вона в своєму вітанні повідомила, що її цікавлять тільки інопланетяни, люди з паралельних світів, гості з майбутнього і екстрасенси, яких вона шукає в своєму класі і чекає зустрічі з ними.

Меланхолія Харухі Судзумії тривав 1 сезон. Нових епізодів не заплановано.