1863 рік. Період завершення шьоґунату і час, коли Японія стояла на порозі великих змін, потопаючи в крові. Молодий сирота Ніо, вірний своїм справам про справедливість, одного разу зустрічає двох людей, яким судилося опинитися в центрі майбутньої революції, — Тошідзо Хіджікату і Окіту Соджі. Вони були засновниками групи бродячих самураїв Мібуро, які в майбутньому стануть Сінсенгумі. Ніо вирішує приєднатися до них, але чи вдасться йому зберегти вірність своїм ідеалам в епоху переворотів і зрад?

Блакитний Мібуро тривав 2 сезони. Нових епізодів не заплановано.